随着社会文化、科学技术的发展，特别是高等教育的高速发展，高校校史馆的数量越来越多，种类也越来越多样。虽然机械的分类容易破坏展陈内容的丰富性和灵活性，但是，基于人类在认识事物过程中，分类的方式有利于管理、说明和识别，还是有必要将校史馆分类描述。大学校史馆不同与普通博物馆之处在于，普通博物馆常常依照藏品和展览所属的学科性质来分类，或依据设立者、管理者的性质分类，或依据经营的方式和财政来源分类，或依据职能和规模分类等等，不一而足。校史馆在所有权上属于大学所有，所以不能依照传统且比较粗线条的上述几种方式进行分类。唯有依据校史馆较为具体的展陈主题、主要藏品、研究内容、教育活动的性质和特点等进行分类阐述，方能概括校史馆的不同特色。
　　综合类校史馆
　　综合类校史馆的主要内容为综合展现大学的历史，包括建校以来的建设和发展、校史上的重大事件和研究成果、著名校友等等。国内比较有代表性的综合类校史馆包括北京大学校史馆、清华大学校史馆、上海交通大学校史馆、同济大学校史馆、四川大学校史馆等。
　　特定历史事件类校史馆
　　特定历史事件类校史馆，是基于建国之前的战争或建国之后的院系调整等原因出现的纪念现代教育史上有重大影响的事件、人物的专题校史馆。这种校史馆有一定特殊性。首先，它的主题和内容局限于一定历史时期，多为展现战争和物资匮乏时期筚路蓝缕的艰苦奋斗精神，以激励年轻人自强不息。其次，高等院校是人才和知识高度密集的地方，在学校发展的历程中，出现的一些重大事件与国家甚至世界的历史密切相关，一些重要的学者生前在高校留下的手稿和遗迹也具有珍贵的历史和文物价值。再次，与展陈内容相关的院校现在多已消失，或被拆解，或被合并为新校，成为现实生活中不再存在的历史，其校史纪念馆多依托于其“后身”的院校，这也使得高校校史馆出现了专题化的可能性。综上，特定历史事件类校史馆在校史研究和教育功能上都有特殊的意义。国内比较有代表性的特定历史事件类校史馆包括西安交通大学的交大西迁历史纪念馆、云南师范大学的西南联大纪念馆、武汉大学的乐山纪念堂、中山大学的孙中山纪念馆、东南大学的吴健雄纪念馆等。
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